Βιοπληροφορική

Γκέλης Σπυρίδων, Καππάς Ηλίας, Σκούρας Ζαχαρίας

Περιγραφή

Κατάρτιση σε εφαρμογές της πληροφορικής πάνω στην οργάνωση και κατανόηση της βιολογικής πληροφορίας. Εξοικείωση με τη διαχείριση, τον έλεγχο και την ανάλυση μοριακών δεδομένων με απώτερο σκοπό την εξαγωγή βιολογικών συμπερασμάτων. Απόκτηση ικανότητας χρήσης των πολυάριθμων βάσεων δεδομένων βιολογικής πληροφορίας μέσω του διαδικτύου. Εξοικείωση με εργαλεία ανάκτησης, σύγκρισης και ανάλυσης βιολογικής πληροφορίας. Εξοικείωση με τη χρήση προγραμμάτων ηλεκτρονικών υπολογιστών και εξυπηρετητών διαδικτύου για την εύρεση ομολογίας, τη γενετική ανάλυση, την ανάλυση γονιδιωμάτων, τον καθορισμό τρισδιάστατης δομής μακρομορίων, τη φυλογενετική ανάλυση αλληλουχιών DNA και αμινοξέων. Θεωρητική κατάρτιση στα μοντέλα εξέλιξης και εξοικείωση με τα βασικά βήματα και τις ποικίλες εφαρμογές των φυλογενετικών αναλύσεων.

Περίγραμμα

Διδάσκοντες

Διδάσκοντες:

Σπυρίδων Γκέλης, Λέκτορας
Ηλίας Καππάς, Λέκτορας
Ζαχαρίας Σκούρας, Καθηγητής

Συνεργάτης Ανάπτυξης Περιεχομένου: Στυλιανή Μηνούδη

Περιεχόμενο μαθήματος

Ορισμός, σχεδιασμός και δομή μιας βάσης δεδομένων. Στρατηγικές αναζήτησης. Ανάλυση και αξιολόγηση αποτελεσμάτων αναζήτησης. Ανάλυση ακολουθιών DNA και αμινοξέων. Πρόβλεψη πρωτεϊνικών δομών. Ανάλυση μοτίβων. Σχεδιασμός εκκινητών. Στοίχιση και εύρεση ομολογίας αλληλουχιών. Μοντέλα εξέλιξης. Κατασκευή και αξιολόγηση φυλογενετικών δέντρων. Μελλοντική βιοπληροφορική και εξελίξεις στην υπολογιστική βιολογία.

Μαθησιακοί στόχοι

Ομάδα στόχος

Οι φοιτητές/απόφοιτοι του τμήματος Βιολογίας.

Ενδιαφερόμενοι για τη θεματική περιοχή της γενετικής.

Προαπαιτούμενα

Γενετική, Μοριακή Βιολογία, Εξέλιξη, Βιοστατιστική.

Προτεινόμενα συγγράμματα

Baxevanis A.D. & Ouellette F. (Ελληνική έκδοση). 2004. Βιοπληροφορική. Επιστημονικές Εκδόσεις Παρισιάνου Α.Ε. Αθήνα (Επιμέλεια ελληνικής έκδοσης: Ευάγγελος Ν. Μουδριανάκης, Σταύρος Ι. Χαμόδρακας).

Βιβλιογραφία

Ηλεκτρονικό υλικό στο elearning.auth.gr

Χρήσιμες ιστοσελίδες